Relatório sobre os resultados da análise genética de amostras de tecido de múmias encontradas no Peru. Este relatório foi elaborado em novembro de 2018.
Performers
- Laboratórios CEN4GEN (6756 - 75 Street NW Edmonton, AB Canadá T6E 6T9) - Preparação e sequenciamento de amostras.
- ABRAXAS BIOSYSTEMS SAPI DE CV (México) - análise de dados de computador.
Após uma análise preliminar de qualidade, 3 amostras foram retiradas de 7 amostras enviadas para análise posterior.
Amostras para análise
| Designação | nome original | Nome condicional | Cenário |
| Ancient-0002 | Pescoço Osso Med sentado 00-12 Victoria 4 | Victoria | Fig. 3.117 |
| Ancient-0003 | 1 mão 001 | Mão separada com 3 dedos | Figura 3.118 |
| Ancient-0004 | Momia 5 - DNA | Victoria | Fig. 3.117 |
Para essas amostras, as seguintes operações foram realizadas:
Vídeo promocional:
- Extração de DNA.
- Verificação da qualidade do DNA.
- Multiplicação de DNA.
- Criação de biblioteca de DNA.
- Sequenciamento de DNA.
- Formação de dados sequenciados purificados.
- Controle de qualidade.
- Análise preliminar por sobreposição de leituras de DNA no genoma humano.
- A análise para o isolamento de DNA curto é típica de DNA antigo.
- Sobreposição de Ancient0003 DNA lê em bibliotecas de genoma humano existentes.
- Análise mitocondrial para a detecção de variantes D-loop e outros sites informativos para a determinação de haplótipos mitocondriais.
- Determinação do sexo das amostras Ancient0003.
- Identificação de possíveis organismos estranhos nas amostras.
- Análise de bancos de dados de DNA para identificar semelhanças com organismos conhecidos.
Figura 3.117. Extraindo amostras do pescoço de Victoria.
Para identificar possíveis tipos de organismos presentes nas amostras Ancient0004 e Ancient0002 (Victoria), foi realizado o sketch do DNA genômico (Ondov et al., 2016), no qual grupos de fragmentos curtos, k-mers, foram comparados com as bases de dados disponíveis. O software BBTools foi usado.
Os seguintes organismos foram testados:
- Bactérias.
- Vírus.
- Plasmídeos.
- Fagos.
- Fungi.
- Plastid.
- Diatomáceas.
- Humano.
- Bos Taurus.
- H penzbergensis.
- PhaseolusVulgaris.
-
Mix2: rótulo para os seguintes genomas:
- Cloroplasto de Lotus japonicus, genoma completo.
- Canis lupus familiaris cOR9S3P pseudogene da família 9 de receptores olfatórios da subfamília S (cOR9S3P) no cromossomo 25.
- Mitocôndria de Vigna radiata, genoma completo.
- Cloroplasto de Millettia pinnata, genoma completo.
- Curvibacter lanceolatus ATCC 14669 F624DRAFT_scaffold00015.15, sequência shotgun do genoma completo.
- Asinibacterium sp. OR53 scaffold1, sequência shotgun do genoma completo.
- Bacillus firmus estirpe LK28 32, sequência shotgun do genoma completo.
- Cloroplasto de Bupleurum falcatum, genoma completo.
- Alicycliphilus sp. B1, sequência shotgun do genoma completo.
- Bacillus litoralis cepa C44 Scaffold1, sequência shotgun do genoma completo.
- Chryseobacterium takakiae cepa DSM 26898, sequência shotgun do genoma completo.
- Paenibacillus sp. FSL R5-0490.
- Bacillus halosaccharovorans cepa DSM 25387 Scaffold3, sequência shotgun do genoma completo.
- Rhodospirillales bacterium URHD0017, sequência shotgun do genoma completo.
- Bacillus onubensis cepa 10J4 10J4_trimmed_contig_26, sequência shotgun do genoma completo.
- Radyrhizobium sp. MOS004 mos004_12, sequência shotgun do genoma completo.
- Bacillus sp. UMB0899 ERR1203650.17957_1_62.8, sequência shotgun do genoma completo.
-
Vertebrados: rótulo para os seguintes genomas:
- Amblyraja-radiata_sAmbRad1_p1.fasta.
- bStrHab1_v1.p_Kakapo.fasta.
- bTaeGut1_v1.p_ZebraFinch.fasta.
- GCA_000978405.1_CapAeg_1.0_genomic_CapraAegagrus.fna.
- GCA_002863925.1_EquCab3.0_genomic_Horse.fna.
- GCF_000002275.2_Ornithorhynchus_anatinus_5.0.1_genomic.fna.
- GCF_000002285.3_CanFam3.1_genomic.fna.
- Macaco_GCF_000772875.2_Mmul_8.0.1_genomic.fna.
- rGopEvg1_p1_Gopherus_evgoodei_tortuga.fasta.
- Protozoários.
Figura 3.118. Imagem e radiografia de duas mãos com três dedos.
Depois de todos os filtros, 27974521 leituras para Ancient0002 e 304785398 leituras para Ancient0004 foram recebidas. Isso mostra que 27% do DNA da amostra Ancient0002 e 90% do DNA da amostra Ancient0004 não podem ser identificados com as amostras de DNA dos organismos analisados nas bases de dados disponíveis.
A próxima etapa da análise foi realizada usando o software megahit v1.1.3 (Li et al., 2016). O seguinte resultado foi obtido:
- Ancient0002: 60852 contigs, total 50459431 bp, min 300 bp, max 24990 bp, média 829 bp, N50 868 bp, 884,385 (5,39%) leituras montadas.
- Ancient0003: 54273 contigs, total 52727201 bp, min 300 bp, max 35094 bp, média 972 bp, N50 1200 bp, 20.247.568 (65,69%) leituras montadas.
O resultado da análise é mostrado na figura.
Figura 3.116. Proporção de leituras classificadas para 28073655 leituras Ancient0002 (gráfico superior) e 25084962 leituras Ancient0004 (gráfico inferior) em comparação com 34904805 de base de DNA representando 1109518 grupos taxonômicos.
Conclusão
Como resultado da análise, foi demonstrado que as amostras Ancient0002 e Ancient0004 (Victoria) não correspondem ao genoma humano, enquanto a amostra Ancient0003 corresponde bem ao humano.
Comentário de Korotkov K. G
Observe que a mão com três dedos pertencia a uma criatura grande, comparável em tamanho a Maria, e o resultado obtido corresponde ao resultado da análise de DNA de Maria. Victoria é uma representante de "pequenas criaturas", e o resultado mostra que seu DNA não corresponde a nenhuma criatura terrestre moderna. Naturalmente, não temos dados sobre criaturas antigas que desapareceram ao longo de milhões de anos.
Links
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Materiais fornecidos por Konstantin Georgievich Korotkov (Doutor em Ciências Técnicas, Professor, Universidade de Tecnologias da Informação, Mecânica e Óptica) e Dmitry Vladislavovich Galetsky (Candidato em Ciências Médicas, I. P. Pavlov First St. Petersburg State Medical University)
